超聲波破碎法提取活性污泥DNA及其DGGE分析
論文類型 | 技術(shù)與工程 | 發(fā)表日期 | 2008-04-01 |
來源 | 哈爾濱工業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào) | ||
作者 | 萬晶晶,張汝嘉,邢德峰,謝天卉,趙麗華,任南琪 | ||
關(guān)鍵詞 | 超聲波破碎法;活性污泥;DNA提取; PCR;變性梯度凝膠電泳(DGGE) | ||
摘要 | 為快速提取活性污泥中的微生物DNA,進(jìn)一步應(yīng)用于變性梯度凝膠電泳(DGGE)技術(shù)分析其群落結(jié)構(gòu),采用細(xì)胞超聲波破碎法直接提取反應(yīng)器活性污泥DNA,以16S rRNA V3區(qū)域通用引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,隨后利用DGGE技術(shù)對擴(kuò)增產(chǎn)物的多樣性進(jìn)行評估. 結(jié)果表明,超聲波破碎法可以快速地提取活性污泥DNA,用超聲波破碎法提取到的活性污泥克服了PCR擴(kuò)增困難的問題. 在一定的超聲波功率下,超聲時(shí)間對DNA產(chǎn)率、PCR擴(kuò)增效率和DGGE分析均有很大影響,實(shí)驗(yàn)的最佳超聲時(shí)間為27 s. DGGE分析表明,用該法提取到的 |
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